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近年来人体肠道微生物组成为了研究“新宠”,,,,,,那么人体内的病毒,,,,,,噬菌体呢???
在一项首次针对泌尿系统病毒组的研究中,,,,,,研究职员发明了数百种病毒,,,,,,其中大部分病毒之前从未被测序过。。。
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为,,,,,,可是关于身体许多区域的噬菌体,,,,,,也就是熏染细菌的病毒,,,,,,科学家们所知甚少。。。近期一组研究职员发明,,,,,,在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌自己多得多,,,,,,这项出乎人意料的研究发明宣布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。。。
“由于病毒组的研究很难题,,,,,,因此我们对我们体内的病毒,,,,,,以及它们与康健,,,,,,疾病的关联知之甚少。。。为了填补这方面的知识空缺,,,,,,做这些研究是很是主要的,,,,,,”英国曼彻斯特大学的医学微生物学家Chloe James(未加入该项研究)以为。。。
研究的最先
这项研究最先于芝加哥洛约拉大学(Loyola University)的生物信息学家Catherine Putonti,,,,,,她为了资助她的同事剖析来自181位女性患者膀胱中网络到的序列数据,,,,,,这些患者保存或不保存泌尿系统问题。。。她从中发明了了许多病毒,,,,,,由此她以为对这些病毒序列睁开深入的探讨。。。
Catherine Putonti
Putonti说:“膀胱里有细菌,,,,,,但也不是许多,,,,,,因此我想‘若是没有那么多细菌,,,,,,那么也许就没有多的病毒了’,,,,,,可是让我受惊的是,,,,,,保存很是多的噬菌体。。。”
研究职员在他们研究的200个细菌基因组中判断出大部分细菌都有的450多种可能的噬菌体序列。。。凌驾一半的这些病毒序列从未泛起在任何数据库中过,,,,,,这批注它们可能是泌尿道特有的噬菌体。。。
“这些噬菌体一次又一次地泛起,,,,,,”James说,,,,,,“在所有的微情形中,,,,,,每次针对病毒群体的测序,,,,,,提及的噬菌体都很少,,,,,,此次发明了这么多噬菌体,,,,,,这批注我们不知道的事情还许多。。。”
研究职员发明来自差别女性的噬菌体序列具有相似性,,,,,,这批注可能保存膀胱噬菌体。。。同时他们也发明了泌尿系统保存或者不保存问题女性样本之间噬菌体群体的一些转变,,,,,,这些问题包括膀胱太过活动,,,,,,失禁,,,,,,膀胱疼痛和尿路熏染。。。
为了确定他们发明的噬菌体序列是否完整,,,,,,能否熏染细菌,,,,,,研究职员对纯化后的噬菌体举行了电子显微检测,,,,,,剖析它们是否能剖析作育皿中的细菌。。。效果批注,,,,,,虽然病毒是整合到宿主基因组中,,,,,,但它们仍然能够杀死其它细菌,,,,,,这批注这些是功效性噬菌体。。。
西方大学人类微生物生态学家,,,,,,Jeremy Burton(未加入这项事情)说,,,,,,“此前还没有人完整形貌过膀胱中的噬菌体,,,,,,”但他也提醒说,,,,,,由于作者检测的是实验室中生长的细菌的基因组,,,,,,因此可能错失了一些整合到难以作育的细菌基因组中的噬菌体。。。不过总体来说,,,,,,“这是一篇很是好的论文,,,,,,”他说。。。
由于增添了作育这一办法,,,,,,确实可能丧失了一些噬菌体,,,,,,James说,,,,,,”但这些发明更有意义了,,,,,,由于它们可以将噬菌体序列与细菌宿主关联在一起。。。许多病毒组研究面临的挑战在于找到准确的易感宿主,,,,,,以便能作育噬菌体并发明其功效性作用。。。”
大肠杆菌中疏散出来的一种新型噬菌体的电子显微照片。。。尾投合构批注它属于Myoviridae科。。。
Putonti研究小组已经在从膀胱细菌中疏散出了更多的噬菌体,,,,,,并与临床医生相助,,,,,,确定这些噬菌体是否在尿路疾病中施展作用。。。
“研究职员发明了微生物微情形中病毒群体所造成的潜在影响,,,,,,这一点很是好。。。在我们真正最先相识其作用之前,,,,,,我们需要清晰这里究竟有什么,,,,,,“”华盛顿大学医学院人体微生物和病毒组研究学者Kristine Wylie(未加入该项研究)说。。。

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